Menghabiskan seluruh kariernya di Borussia Dortmund dalam era keemasan Die Borussen pada akhir 1990-an.
Kluivert menjadi super-sub di pertandingan final Liga Champions 1997 melawan Juventus. Ia mencetak gol ketiga tim di pertandngan tersebut, bahkan hanya membutuhkan 16 detik untuk melakukannya.
