Natanael Siringoringo mengawali karier profesional di PSMS Medan pada 2019. Setelahnya, ia merantau ke Sulawesi dengan membela Sulut United setahun kemudian.
Baca Juga
Hanya saja, karier Natanael bersama Sulut United tidak berlangsung lama lantaran kompetisi Liga 2 tidak berlangsung lama karena pandemi.
Natanael Siringoringo kemudian mendapatkan kesempatan bermain di Liga Malaysia dengan memperkuat TRW Kelantan FC pada 2021. Dia bermain 1,5 tahun di kompetisi Liga 2 Malaysia dan mencetak lima gol serta empat assist.
